ARBOCARTO-v2

Outil de cartographie prédictive des densités de population des moustiques Aedes

Projet terminéDestiné aux Agences Régionales de Santé (ARS) et aux opérateurs de démoustication, privés ou publics, l’application Arbocarto-V2 est opérationnelle et disponible via un formulaire de demande auprès du ministère de la Santé et de la Prévention. L’outil génère, sur un territoire donné, des cartographies prédictives de l’abondance de moustiques, Aedes albopictus ou aegypti selon le choix de l’utilisateur, et permet de simuler différents scénarios de prévention ou de contrôle.

PRÉSENTATION

Les moustiques Aedes (Ae. albopictus et Ae. aegypti) sont vecteurs d’agents pathogènes responsables de maladies comme le chickungunya, la dengue et le zika. Ce sont des moustiques urbains, diurnes et particulièrement nuisants en début et fin de journée. La femelle moustique pique l’Homme préférentiellement, ayant besoin d’un repas de sang pour la maturation de ses œufs, avant de les pondre sur une partie sèche de réceptacles (généralement petits, naturels ou artificiels). Les œufs se transformeront en larves lors de la mise en eau de ces gites par la pluie ou l’arrosage. Par ailleurs, les moustiques adultes se nourrissent et se reposent dans la végétation.

Avec la mondialisation des échanges commerciaux et le réchauffement climatique, Ae. albopictus notamment, communément appelé « moustique tigre » originaire d’Asie du Sud Est, s’est propagé en Europe ces dernières décennies et a su « s’acclimater » à nos latitudes : par la mise en hibernation des œufs l’hiver, par exemple – ce que l’on appelle la diapause.

Le risque épidémiologique grandissant, le Ministère français de la santé a souhaité financer le développement d’un démonstrateur de cartographie prédictive des densités de populations d’Aedes vecteurs (Ae. albopictus et Ae. aegypti) à une échelle spatiale adaptée à l’organisation des actions de surveillance et de contrôle à partir de données entomologiques locales, météorologiques et de télédétection à haute et très haute résolution spatiale pour déterminer l’occupation des sols (trame verte, type d'urbanisation). Les cartes produites par l’outil permettent de cibler en priorité les lieux où un risque d'abondance de moustiques est très élevé, afin d'orienter les actions de mobilisation sociale de lutte anti-vectorielle et d'ajuster les actions des équipes terrain aux quartiers à risque. Les prédictions issues d’ARBOCARTO peuvent être intégrées au serveur national du Ministère de la santé pour être croisées avec les données épidémiologiques et entomologiques de terrain.

Le projet ARBOCARTO-V1 (2018-2019) s’est inscrit dans la convention-cadre de coopération signée entre la Direction Générale de la Santé (DGS), le service de santé des armées et le Centre national d’études spatiales (CNES). Le démonstrateur ARBOCARTO-V1 a été développé par un Consortium réunissant l’entente interdépartementale pour la démoustication (EID) Rhône-Alpes, l’EID-Atlantique, l’EID-Méditerranée, les Agences Régionales de Santé (ARS) Nouvelle Aquitaine, Auvergne Rhône-Alpes, Occitanie et Martinique, la collectivité territoriale de Martinique, le CIRAD, l’Institut de recherche pour le développement (IRD) et Marie Demarchi, profession libérale basée à la Maison de la Télédétection. ARBOCARTO fait suite à de nombreux travaux de recherche menés par le Cirad notamment, et aux outils opérationnels développés dans le cadre du projet Life + « Télédétection et anticipation » entre 2009 et 2013 pour l’Eid Méditerranée et le projet Alborun développé pour l’Agence Régionale de Santé de la Réunion.

ARBOCARTO est une application évolutive et paramétrable simplement. ARBOCARTO-V1 propose déjà une interface simple, et des outils d’accompagnement (manuel utilisateur, kit de formation (constitué de jeux de données test et supports de formation : présentation du projet et des concepts + support de travaux pratiques). Il fonctionne sur des postes bureautiques avec comme seule contrainte logicielle, l’installation préalable de JAVA 8. 

Par les adaptations réalisées avec ARBOCARTO-V2, l’utilisation de l’outil peut à présent être réalisée quels que soient les contextes géographiques pour les deux espèces, Ae. aegypti, et Ae. albopictus, diapausant ou non. D’autre part, de nouvelles fonctionnalités ont été ajoutées (intégration de nouveaux scenarii de lutte antivectorielle) et optimisées (gestion géographique, temps de calcul, gestion du formatage des données d’entrée).

L’outil nécessite en entrée des données météorologiques quotidiennes et des informations environnementales, dont la mise à jour assure la pertinence de la localisation des prédictions de présence du moustique. Le projet SCO ARBOCARTO-V2 a produit un guide méthodologique pour fournir toutes les clés à des non spécialistes de la géomatique et de la télédétection, pour leur permettre d’intégrer à Arbocarto les données environnementales disponibles dans un contexte d’ouverture des données (Open data).

Site(s) d’application

ARBOCARTO V2 peut être utilisé par les acteurs de la santé sur tous les territoires déjà colonisés par les moustiques Ae. albopictus et Ae. aegypti  en France métropolitaine et régions d’outre-mer. Les tests concernant la production de mise à jour partielle de données environnementales et comparaison des modélisations produites à partir de divers jeux de données, ont porté sur : 

• Montpellier et sa région
• Grenoble et sa région
• Bordeaux
• La Réunion
• Mayotte
• Antilles Françaises

DONNÉES

Satellite

• SPOT6/7
• Sentinel-2

Autres

• Données d’occupation du sol : Urban Atlas, occupations du sol produites par le CES OSO, l’IGN (OCS GE)
• Open data : OpenStreetMap
• Découpage IRIS (INSEE – IGN)
• Données météorologiques : pluies et températures quotidiennes (Météo-France)

RÉSULTATS - PRODUITS FINAUX

• Application ARBOCARTO, nouvelle version V2 : optimisation de certaines fonctionnalités, amélioration de l’ergonomie des fenêtres de paramétrages et intégration de nouveaux scénarii de lutte anti-vectorielle.

Exemples de sortie de l’outil ARBOCARTO : simulation des densités de moustiques adultes Aedes albopictus sur les territoires d'expérimentation. Du vert, zones à faible densité, au rouge, zones à densité élevée. © Arbocarto

• Accès gratuit à l’application : Arbocarto est un logiciel au format .exe dont la demande se fait auprès du Ministère de la Santé, propriétaire de l’outil, via le formulaire disponible ici. Ce dernier implique de s’engager à faire un retour utilisateur une fois par an auprès du ministère de la santé.

• Mise à jour du manuel utilisateur et création d’un guide méthodologique pour les acteurs de santé concernant la création ou la mise à jour de données environnementales issues d’images satellitaires. Ces documents sont téléchargeables en français et en anglais dans la section Ressources ci-dessous.

💡Bon à savoir : Une convention avec le ministère de la Santé et Météo-France permet aux utilisateurs (ARS et opérateurs de démoustication) de récupérer les données locales à la fréquence qu’ils souhaitent.

• Création du site internet www.arbocarto.fr

Références

Arbocarto V2 sur GEO Knowledge Hub du Group on Earth Observations (GEO), un référentiel numérique pérenne : https://doi.org/10.60566/dckq9-7p159

Les actus du projet

• 23/05/2024 : Arbocarto ouvre une version en ligne, GUS se dévoile, présentation des 2 projets SCO au séminaire Theia « Télédétection, Modélisation, Santé & Environnement »

• 27/11/2023 : Quand les projets Santé du SCO se font références, un zoom sur ClimHealth, sélectionné par l'OMM comme case Study de son rapport en prévision la COP28, et Arbocarto, identifié par le COVARS français pour la lutte contre les arboviroses.

• Formation à l’utilisation d’ARBOCARTO : Du 20 au 24 novembre 2023, une formation utilisateurs a été organisée au centre IRD de Cayenne pour la prise en main du logiciel ARBOCARTO et de QGis.

• 05/12/2022 : Aedes prends garde à toi ! l'interview des porteurs du projet Arbocarto-V2 pour décrypter son histoire, sa mise en oeuvre et ses perspectives

• Juin 2022 : Une journée-atelier de restitution du projet ARBOCARTO-V2 est organisée le jeudi 30 juin, à la Maison de la Télédétection à Montpellier.

• Mai 2022 : Communication scientifique – présentation d’ARBOCARTO au Living Planet Symposium à Bonn

• Mai 2022 : Communication scientifique – présentation d’ARBOCARTO lors du 5e atelier international sur le moustique tigre, Aedes albopictus, à Montpellier du 11 au 13 mai

• Avril 2022 : Formations utilisateurs. Trois premières sessions de formation à l'outil ARBOCARTO-V2 (version beta) ont été organisées en avril-mai 2022 pour les utilisateurs des Agences Régionales de Santé et Ententes Interdépartementales de Démoustication). Leurs retours utilisateurs entre la formation et la fin du projet vont permettre de finaliser la V2.

• Mars 2022 : Salon MedInTechs – Présentation de l’outil ARBOCARTO lors d’une table ronde animée par le CNES « Le spatial, un moteur d’innovation en santé »

• Février 2022 : Publication d’une fiche d’usage Arbocarto sur le site Applisat, un site dédié à tous les utilisateurs publics d’images satellitaires et leurs partenaires.

• Avril 2021 : le site internet www.arbocarto.fr est en ligne ! En cours de finalisation, Arbocarto-V2 sera disponible mi-2022, formations utilisateurs à l’appui

• 25/10/2021 : Télésurveillance épidémiologique : retour sur la 2ème Trimestrielle du SCO France